Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN7O95471 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms