Protein–RNA interactions for Protein: O75955

FLOT1, Flotillin-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLOT1O75955 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FLOT1O75955 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FLOT1O75955 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms