Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LGR5O75473 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGR5O75473 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGR5O75473 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGR5O75473 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGR5O75473 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LGR5O75473 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGR5O75473 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGR5O75473 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGR5O75473 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGR5O75473 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGR5O75473 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGR5O75473 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LGR5O75473 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGR5O75473 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGR5O75473 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGR5O75473 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGR5O75473 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGR5O75473 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGR5O75473 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGR5O75473 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGR5O75473 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LGR5O75473 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LGR5O75473 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LGR5O75473 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LGR5O75473 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LGR5O75473 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LGR5O75473 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LGR5O75473 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LGR5O75473 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LGR5O75473 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LGR5O75473 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LGR5O75473 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LGR5O75473 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LGR5O75473 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LGR5O75473 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LGR5O75473 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LGR5O75473 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LGR5O75473 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LGR5O75473 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LGR5O75473 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LGR5O75473 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LGR5O75473 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LGR5O75473 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LGR5O75473 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LGR5O75473 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LGR5O75473 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LGR5O75473 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LGR5O75473 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LGR5O75473 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LGR5O75473 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LGR5O75473 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LGR5O75473 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LGR5O75473 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LGR5O75473 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LGR5O75473 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LGR5O75473 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LGR5O75473 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LGR5O75473 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LGR5O75473 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGR5O75473 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGR5O75473 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGR5O75473 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGR5O75473 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGR5O75473 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGR5O75473 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGR5O75473 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGR5O75473 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGR5O75473 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGR5O75473 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGR5O75473 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGR5O75473 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGR5O75473 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGR5O75473 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGR5O75473 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGR5O75473 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGR5O75473 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LGR5O75473 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGR5O75473 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGR5O75473 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGR5O75473 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGR5O75473 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGR5O75473 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGR5O75473 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGR5O75473 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGR5O75473 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGR5O75473 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGR5O75473 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGR5O75473 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGR5O75473 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGR5O75473 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGR5O75473 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGR5O75473 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGR5O75473 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGR5O75473 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGR5O75473 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGR5O75473 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGR5O75473 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGR5O75473 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGR5O75473 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms