Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SIN3BO75182 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3BO75182 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms