Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EFNA2O43921 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
EFNA2O43921 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms