Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EDIL3O43854 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EDIL3O43854 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms