Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNGR3O43761 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYNGR3O43761 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms