Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms