Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRKAB2O43741 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms