Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms