Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATCO43716 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATCO43716 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATCO43716 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATCO43716 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATCO43716 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATCO43716 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATCO43716 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATCO43716 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATCO43716 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATCO43716 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATCO43716 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATCO43716 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATCO43716 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATCO43716 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATCO43716 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATCO43716 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATCO43716 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATCO43716 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATCO43716 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GATCO43716 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GATCO43716 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GATCO43716 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATCO43716 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATCO43716 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATCO43716 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATCO43716 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATCO43716 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATCO43716 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATCO43716 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATCO43716 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATCO43716 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATCO43716 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATCO43716 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GATCO43716 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GATCO43716 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GATCO43716 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GATCO43716 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GATCO43716 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GATCO43716 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GATCO43716 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GATCO43716 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GATCO43716 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GATCO43716 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GATCO43716 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GATCO43716 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GATCO43716 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GATCO43716 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GATCO43716 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GATCO43716 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GATCO43716 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GATCO43716 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GATCO43716 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GATCO43716 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GATCO43716 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GATCO43716 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GATCO43716 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GATCO43716 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GATCO43716 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GATCO43716 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GATCO43716 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GATCO43716 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GATCO43716 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
GATCO43716 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATCO43716 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATCO43716 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATCO43716 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATCO43716 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATCO43716 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATCO43716 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATCO43716 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATCO43716 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATCO43716 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATCO43716 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATCO43716 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATCO43716 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATCO43716 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATCO43716 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATCO43716 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATCO43716 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATCO43716 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATCO43716 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATCO43716 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATCO43716 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATCO43716 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATCO43716 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATCO43716 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATCO43716 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GATCO43716 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATCO43716 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATCO43716 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATCO43716 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATCO43716 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATCO43716 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATCO43716 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GATCO43716 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GATCO43716 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATCO43716 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATCO43716 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATCO43716 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms