Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DENRO43583 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DENRO43583 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DENRO43583 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DENRO43583 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DENRO43583 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DENRO43583 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DENRO43583 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DENRO43583 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DENRO43583 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DENRO43583 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DENRO43583 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DENRO43583 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DENRO43583 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DENRO43583 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DENRO43583 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DENRO43583 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DENRO43583 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DENRO43583 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DENRO43583 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DENRO43583 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DENRO43583 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DENRO43583 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DENRO43583 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DENRO43583 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DENRO43583 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DENRO43583 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DENRO43583 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DENRO43583 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DENRO43583 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DENRO43583 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DENRO43583 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DENRO43583 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DENRO43583 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DENRO43583 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DENRO43583 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DENRO43583 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DENRO43583 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DENRO43583 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DENRO43583 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DENRO43583 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DENRO43583 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DENRO43583 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DENRO43583 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DENRO43583 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DENRO43583 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DENRO43583 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DENRO43583 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DENRO43583 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DENRO43583 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DENRO43583 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DENRO43583 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DENRO43583 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DENRO43583 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DENRO43583 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DENRO43583 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DENRO43583 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DENRO43583 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DENRO43583 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DENRO43583 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DENRO43583 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DENRO43583 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DENRO43583 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DENRO43583 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DENRO43583 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DENRO43583 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DENRO43583 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DENRO43583 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DENRO43583 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DENRO43583 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DENRO43583 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DENRO43583 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DENRO43583 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DENRO43583 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DENRO43583 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DENRO43583 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DENRO43583 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DENRO43583 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DENRO43583 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DENRO43583 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DENRO43583 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DENRO43583 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DENRO43583 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DENRO43583 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DENRO43583 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DENRO43583 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DENRO43583 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DENRO43583 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DENRO43583 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DENRO43583 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DENRO43583 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DENRO43583 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DENRO43583 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DENRO43583 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DENRO43583 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DENRO43583 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DENRO43583 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DENRO43583 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DENRO43583 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DENRO43583 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms