Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD6O43541 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD6O43541 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD6O43541 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD6O43541 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD6O43541 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD6O43541 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD6O43541 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD6O43541 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD6O43541 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD6O43541 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD6O43541 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD6O43541 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD6O43541 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD6O43541 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD6O43541 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD6O43541 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD6O43541 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD6O43541 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD6O43541 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD6O43541 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD6O43541 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMAD6O43541 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms