Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GPAA1O43292 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPAA1O43292 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms