Protein–RNA interactions for Protein: O15534

PER1, Period circadian protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PER1O15534 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PER1O15534 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PER1O15534 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PER1O15534 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PER1O15534 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PER1O15534 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PER1O15534 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PER1O15534 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PER1O15534 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PER1O15534 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PER1O15534 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PER1O15534 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PER1O15534 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PER1O15534 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PER1O15534 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PER1O15534 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PER1O15534 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PER1O15534 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PER1O15534 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PER1O15534 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PER1O15534 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PER1O15534 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PER1O15534 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PER1O15534 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PER1O15534 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PER1O15534 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PER1O15534 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PER1O15534 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PER1O15534 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PER1O15534 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PER1O15534 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PER1O15534 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PER1O15534 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PER1O15534 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PER1O15534 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PER1O15534 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PER1O15534 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PER1O15534 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PER1O15534 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PER1O15534 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PER1O15534 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PER1O15534 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PER1O15534 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PER1O15534 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PER1O15534 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PER1O15534 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PER1O15534 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PER1O15534 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PER1O15534 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PER1O15534 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PER1O15534 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PER1O15534 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PER1O15534 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PER1O15534 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PER1O15534 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PER1O15534 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PER1O15534 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PER1O15534 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PER1O15534 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PER1O15534 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PER1O15534 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PER1O15534 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PER1O15534 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PER1O15534 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PER1O15534 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PER1O15534 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PER1O15534 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PER1O15534 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PER1O15534 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PER1O15534 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PER1O15534 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PER1O15534 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PER1O15534 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PER1O15534 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PER1O15534 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PER1O15534 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PER1O15534 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PER1O15534 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PER1O15534 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PER1O15534 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PER1O15534 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PER1O15534 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PER1O15534 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PER1O15534 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PER1O15534 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PER1O15534 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PER1O15534 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PER1O15534 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PER1O15534 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PER1O15534 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PER1O15534 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PER1O15534 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PER1O15534 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PER1O15534 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PER1O15534 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PER1O15534 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PER1O15534 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PER1O15534 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PER1O15534 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PER1O15534 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms