Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP290O15078 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP290O15078 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP290O15078 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP290O15078 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP290O15078 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP290O15078 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP290O15078 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP290O15078 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP290O15078 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP290O15078 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP290O15078 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP290O15078 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP290O15078 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP290O15078 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP290O15078 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP290O15078 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP290O15078 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP290O15078 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP290O15078 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP290O15078 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP290O15078 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP290O15078 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP290O15078 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP290O15078 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP290O15078 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP290O15078 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP290O15078 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP290O15078 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP290O15078 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP290O15078 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP290O15078 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP290O15078 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP290O15078 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP290O15078 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP290O15078 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP290O15078 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP290O15078 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP290O15078 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP290O15078 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP290O15078 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP290O15078 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP290O15078 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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CEP290O15078 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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CEP290O15078 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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CEP290O15078 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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CEP290O15078 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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CEP290O15078 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP290O15078 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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CEP290O15078 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP290O15078 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP290O15078 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
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CEP290O15078 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP290O15078 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
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CEP290O15078 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP290O15078 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP290O15078 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP290O15078 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
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CEP290O15078 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP290O15078 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP290O15078 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP290O15078 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP290O15078 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP290O15078 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP290O15078 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP290O15078 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
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CEP290O15078 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP290O15078 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP290O15078 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP290O15078 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP290O15078 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP290O15078 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP290O15078 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP290O15078 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP290O15078 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP290O15078 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP290O15078 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP290O15078 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP290O15078 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP290O15078 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP290O15078 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
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