Protein–RNA interactions for Protein: O14830

PPEF2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPEF2O14830 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPEF2O14830 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPEF2O14830 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPEF2O14830 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPEF2O14830 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPEF2O14830 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPEF2O14830 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPEF2O14830 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPEF2O14830 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PPEF2O14830 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPEF2O14830 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPEF2O14830 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPEF2O14830 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPEF2O14830 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPEF2O14830 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPEF2O14830 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPEF2O14830 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPEF2O14830 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPEF2O14830 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPEF2O14830 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPEF2O14830 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPEF2O14830 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPEF2O14830 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPEF2O14830 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPEF2O14830 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPEF2O14830 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PPEF2O14830 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPEF2O14830 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPEF2O14830 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPEF2O14830 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPEF2O14830 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPEF2O14830 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPEF2O14830 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPEF2O14830 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPEF2O14830 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PPEF2O14830 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPEF2O14830 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms