Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHOX2AO14813 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms