Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RGPD8O14715 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms