Protein–RNA interactions for Protein: O00472

ELL2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL2O00472 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ELL2O00472 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ELL2O00472 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ELL2O00472 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ELL2O00472 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ELL2O00472 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ELL2O00472 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ELL2O00472 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ELL2O00472 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ELL2O00472 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ELL2O00472 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ELL2O00472 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ELL2O00472 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ELL2O00472 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ELL2O00472 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ELL2O00472 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ELL2O00472 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ELL2O00472 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ELL2O00472 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ELL2O00472 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ELL2O00472 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ELL2O00472 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ELL2O00472 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ELL2O00472 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ELL2O00472 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ELL2O00472 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ELL2O00472 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ELL2O00472 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ELL2O00472 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ELL2O00472 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ELL2O00472 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ELL2O00472 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ELL2O00472 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ELL2O00472 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ELL2O00472 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ELL2O00472 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ELL2O00472 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ELL2O00472 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ELL2O00472 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ELL2O00472 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ELL2O00472 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ELL2O00472 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ELL2O00472 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ELL2O00472 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ELL2O00472 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ELL2O00472 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ELL2O00472 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ELL2O00472 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ELL2O00472 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ELL2O00472 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ELL2O00472 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ELL2O00472 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ELL2O00472 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ELL2O00472 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ELL2O00472 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ELL2O00472 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ELL2O00472 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ELL2O00472 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ELL2O00472 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ELL2O00472 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ELL2O00472 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ELL2O00472 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ELL2O00472 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ELL2O00472 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ELL2O00472 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ELL2O00472 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ELL2O00472 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ELL2O00472 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ELL2O00472 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ELL2O00472 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ELL2O00472 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ELL2O00472 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ELL2O00472 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ELL2O00472 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ELL2O00472 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ELL2O00472 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ELL2O00472 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ELL2O00472 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ELL2O00472 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ELL2O00472 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ELL2O00472 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ELL2O00472 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ELL2O00472 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ELL2O00472 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ELL2O00472 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ELL2O00472 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ELL2O00472 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ELL2O00472 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ELL2O00472 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ELL2O00472 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ELL2O00472 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ELL2O00472 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ELL2O00472 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ELL2O00472 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ELL2O00472 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ELL2O00472 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ELL2O00472 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ELL2O00472 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ELL2O00472 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ELL2O00472 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms