Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVH48-1M5A8F1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVH48-1M5A8F1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVH48-1M5A8F1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVH48-1M5A8F1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVH48-1M5A8F1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVH48-1M5A8F1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVH48-1M5A8F1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVH48-1M5A8F1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVH48-1M5A8F1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVH48-1M5A8F1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVH48-1M5A8F1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVH48-1M5A8F1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVH48-1M5A8F1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVH48-1M5A8F1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVH48-1M5A8F1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVH48-1M5A8F1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVH48-1M5A8F1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVH48-1M5A8F1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVH48-1M5A8F1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVH48-1M5A8F1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVH48-1M5A8F1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVH48-1M5A8F1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVH48-1M5A8F1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVH48-1M5A8F1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVH48-1M5A8F1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVH48-1M5A8F1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVH48-1M5A8F1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVH48-1M5A8F1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVH48-1M5A8F1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVH48-1M5A8F1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVH48-1M5A8F1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVH48-1M5A8F1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVH48-1M5A8F1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVH48-1M5A8F1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVH48-1M5A8F1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms