Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PATL2C9JE40 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms