Protein–RNA interactions for Protein: A8MV81

HIGD1C, HIG1 domain family member 1C, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1CA8MV81 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms