Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYSRT1A8MQ03 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms