Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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