Protein–RNA interactions for Protein: A6NKX1

FAM223B, Protein FAM223B, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM223BA6NKX1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM223BA6NKX1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM223BA6NKX1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms