Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCNX2A6NKB5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCNX2A6NKB5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCNX2A6NKB5 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCNX2A6NKB5 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCNX2A6NKB5 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCNX2A6NKB5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCNX2A6NKB5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCNX2A6NKB5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCNX2A6NKB5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCNX2A6NKB5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCNX2A6NKB5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCNX2A6NKB5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCNX2A6NKB5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCNX2A6NKB5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCNX2A6NKB5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCNX2A6NKB5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCNX2A6NKB5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCNX2A6NKB5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCNX2A6NKB5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCNX2A6NKB5 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms