Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C9orf92A6NGG3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
C9orf92A6NGG3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms