Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN7

FAM149A, Protein FAM149A, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149AA5PLN7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM149AA5PLN7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM149AA5PLN7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM149AA5PLN7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM149AA5PLN7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM149AA5PLN7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM149AA5PLN7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM149AA5PLN7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM149AA5PLN7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM149AA5PLN7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM149AA5PLN7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM149AA5PLN7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM149AA5PLN7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM149AA5PLN7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM149AA5PLN7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM149AA5PLN7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM149AA5PLN7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM149AA5PLN7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM149AA5PLN7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM149AA5PLN7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM149AA5PLN7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM149AA5PLN7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM149AA5PLN7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM149AA5PLN7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM149AA5PLN7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM149AA5PLN7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM149AA5PLN7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM149AA5PLN7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM149AA5PLN7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM149AA5PLN7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM149AA5PLN7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM149AA5PLN7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM149AA5PLN7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FAM149AA5PLN7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FAM149AA5PLN7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM149AA5PLN7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms