Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.1 ms