Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 MAP4-210ENST00000439356 2743 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 OR10K1-201ENST00000289451 1073 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 RN7SKP133-201ENST00000364845 340 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 RN7SKP204-201ENST00000365481 310 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 LINC00272-201ENST00000367563 740 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 MRPL48-204ENST00000411840 1197 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 PIGX-204ENST00000421265 677 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 CD59-204ENST00000426650 741 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 AL139220.2-213ENST00000431800 674 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 AC097382.1-201ENST00000441093 591 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 RBMY2OP-201ENST00000447105 810 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 AL161937.1-202ENST00000451960 341 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 AC004448.4-203ENST00000456537 441 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 AC091152.1-201ENST00000472109 838 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 AC010261.2-202ENST00000506875 494 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 MEF2C-AS1-203ENST00000508718 483 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 AP000757.1-202ENST00000525260 891 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 AP003532.1-201ENST00000529936 310 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 RASA4-217ENST00000538869 483 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 ACTR3C-205ENST00000539352 570 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 BANF2-205ENST00000545418 360 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 FAM174B-202ENST00000553393 495 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 AC122685.1-202ENST00000556750 555 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 AC093249.5-201ENST00000568120 430 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 RN7SL203P-201ENST00000579600 296 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 AC243960.5-201ENST00000597858 255 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 uc_338.2-201ENST00000612963 182 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 FP236315.1-201ENST00000623723 457 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 ZMYND8-206ENST00000372023 5144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 ODF2-209ENST00000434106 3890 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 CACNB4-239ENST00000636947 5575 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 OR2T35-202ENST00000641268 2957 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 GCNT1-202ENST00000442371 5972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 CD86-201ENST00000264468 2634 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 MRPS27-202ENST00000457646 2628 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 ANKS1B-220ENST00000550693 3372 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 DCX-201ENST00000356220 3019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 CASP14-201ENST00000427043 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 UNC5D-206ENST00000453357 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 SERPINB4-201ENST00000341074 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 AL135818.1-202ENST00000554096 1740 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 NAA40-202ENST00000377793 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 OR8B9P-202ENST00000642028 5216 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 KCNMA1-214ENST00000434208 4055 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 LINC00649-203ENST00000427447 9124 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 LUARIS-201ENST00000436105 2916 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 WDHD1-202ENST00000420358 3722 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 MORF4L2-203ENST00000422154 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 FMO5-202ENST00000369272 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 HSP90AB2P-201ENST00000507090 2176 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 TLN2-209ENST00000561311 11880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 PCBD2-204ENST00000512783 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 UFL1-201ENST00000369278 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 ZNF544-206ENST00000596652 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 ZNF544-217ENST00000600220 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 MITF-203ENST00000328528 4680 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 AC109826.1-201ENST00000419865 1424 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 CLOCK-202ENST00000381322 4059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 GPM6B-201ENST00000316715 3275 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 PTPN3-201ENST00000262539 6832 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 ZBTB20-AS1-203ENST00000475939 1687 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 CLDN12-201ENST00000287916 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 ERLIN2-211ENST00000523887 2347 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 ZNF708-201ENST00000356929 4004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 CD244-201ENST00000322302 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 IL4-202ENST00000350025 414 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 COX7A2-202ENST00000370089 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 MRPL47-202ENST00000392659 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 CEP250-202ENST00000397527 15703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 MED20-203ENST00000409060 815 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 AC003075.1-208ENST00000415246 596 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 MAGEB6P1-201ENST00000416929 1224 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 AP000997.1-201ENST00000424313 479 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 LINC00892-202ENST00000429841 529 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 AC239727.1-201ENST00000431432 623 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 RALY-AS1-202ENST00000432859 610 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 AC009988.1-201ENST00000434988 310 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 TMEM127-203ENST00000435268 582 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 AP000350.3-201ENST00000440099 289 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 IGKV1D-35-201ENST00000442736 271 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 AC242426.2-201ENST00000446956 795 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 AC003075.1-206ENST00000448664 541 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 OR11Q1P-201ENST00000451582 877 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 LINC00297-201ENST00000453470 913 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 RPSAP54-201ENST00000454001 886 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 DEFA10P-201ENST00000455014 288 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 AC002384.1-202ENST00000470135 673 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 RPL12P42-201ENST00000481802 499 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 ANGPT2-203ENST00000523120 2997 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 IGKV3-25-201ENST00000523155 253 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 AC015468.1-201ENST00000523852 874 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 C15orf40-209ENST00000538348 561 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 CCND2P1-201ENST00000539268 799 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 TMEM132D-AS1-206ENST00000541320 440 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 ACTN1-AS1-201ENST00000553944 484 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 PSMA3-AS1-211ENST00000556225 839 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 NPC2-209ENST00000557510 1029 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTGFRP43088 AC015871.1-201ENST00000557880 1081 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
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