Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 OR2T6-201ENST00000355728 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 RN7SKP45-201ENST00000363509 304 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 CNST-201ENST00000366511 645 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 AC121338.1-201ENST00000380601 1287 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 CFAP61-207ENST00000389656 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 IGLV3-1-201ENST00000390319 398 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 LINC01738-201ENST00000454285 815 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 AC069213.3-201ENST00000454858 474 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 RN7SL420P-201ENST00000463843 298 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 ACPP-203ENST00000475741 1242 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 FAM107B-228ENST00000496330 697 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 AC008629.1-201ENST00000506486 812 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 AC098679.2-201ENST00000513067 365 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 LINC02222-201ENST00000513535 1039 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 SCAND2P-204ENST00000541103 669 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 AL355916.3-201ENST00000556347 779 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 AC051619.5-203ENST00000561404 529 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 AP005202.3-201ENST00000582033 567 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 AC005379.1-201ENST00000585647 328 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 AC005329.2-202ENST00000589673 392 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 AC011472.5-201ENST00000624079 508 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 AL121785.1-201ENST00000624745 708 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 LINC01320-209ENST00000625995 928 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 Metazoa_SRP.211-201ENST00000635920 276 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 CHRDL1-201ENST00000372042 1934 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 FLT1-206ENST00000615611 1476 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 SH3D19-204ENST00000427414 2656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 TTC39A-212ENST00000447632 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 PTPN14-201ENST00000366956 12985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 GJC1-201ENST00000330514 3295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 PAICS-202ENST00000399688 3297 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 GANC-201ENST00000318010 7781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 ZNF331-216ENST00000511593 1985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 AC110926.1-201ENST00000412499 2825 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 MR1-204ENST00000367580 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 POLH-201ENST00000372226 3322 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
TMEM225BP0DP42 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 NBPF19-206ENST00000621744 14425 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 NCAPH-201ENST00000240423 2763 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 SELENON-205ENST00000630065 2994 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 ANKS1B-220ENST00000550693 3372 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 AURKA-203ENST00000371356 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 PHYHIPL-202ENST00000373880 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 BDNF-206ENST00000395983 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 MEP1B-201ENST00000269202 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 LRBA-204ENST00000507224 8826 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 NCKAP1L-201ENST00000293373 9016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 KAT6B-205ENST00000372725 6944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 SORL1-212ENST00000534286 3501 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 PSMD10-203ENST00000340200 713 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 PSMD10-204ENST00000361815 768 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 BPHL-202ENST00000380375 1050 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 IGLV1-51-201ENST00000390290 389 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 ATG10-IT1-201ENST00000396880 487 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 RNA5SP221-201ENST00000411271 103 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 AC103563.8-201ENST00000415716 318 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 DSCR10-201ENST00000432141 860 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 AL445189.2-201ENST00000447543 259 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 AC073583.1-201ENST00000447553 400 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 LINC01647-201ENST00000453135 1285 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 AL391825.1-202ENST00000458136 741 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 AL355312.3-201ENST00000472053 312 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 GPN1-209ENST00000503738 984 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 RACK1-211ENST00000504726 388 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 SPINK1-203ENST00000510027 1188 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 SRD5A3-AS1-202ENST00000510637 926 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 AC024451.3-201ENST00000517810 463 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 AC122713.1-201ENST00000518368 1015 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 AC087273.2-201ENST00000519038 634 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 SAP30L-AS1-204ENST00000524264 1039 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 WT1-AS-206ENST00000525436 1254 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 PROSER3-207ENST00000537459 772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 AC079031.2-201ENST00000537742 615 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 FOXG1-AS1-201ENST00000546560 538 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 AC018448.2-201ENST00000548295 305 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 TUBA1C-204ENST00000549183 696 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 OR7E159P-201ENST00000553761 298 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 LINC01572-202ENST00000563770 568 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 CDRT7-201ENST00000568256 767 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 AC090774.3-201ENST00000578666 742 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 AC010776.1-201ENST00000588298 542 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 WFDC21P-207ENST00000590346 630 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 AL137002.1-201ENST00000600642 182 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 AP000962.1-201ENST00000602654 729 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 uc_338.27-201ENST00000611385 169 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 Metazoa_SRP.29-201ENST00000616220 280 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 MIR6749-201ENST00000617008 69 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 AL136038.5-201ENST00000620835 554 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 AC127381.3-201ENST00000622901 303 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 AC010894.5-201ENST00000624428 951 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TMEM225BP0DP42 RANBP2-205ENST00000629728 156 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms