Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SNX9Q9Y5X1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX9Q9Y5X1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms