Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

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Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDHB12Q9Y5F1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDHB12Q9Y5F1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDHB12Q9Y5F1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDHB12Q9Y5F1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDHB12Q9Y5F1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDHB12Q9Y5F1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDHB12Q9Y5F1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHB12Q9Y5F1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHB12Q9Y5F1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHB12Q9Y5F1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHB12Q9Y5F1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHB12Q9Y5F1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHB12Q9Y5F1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHB12Q9Y5F1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHB12Q9Y5F1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHB12Q9Y5F1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHB12Q9Y5F1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHB12Q9Y5F1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHB12Q9Y5F1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHB12Q9Y5F1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCDHB12Q9Y5F1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCDHB12Q9Y5F1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCDHB12Q9Y5F1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCDHB12Q9Y5F1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHB12Q9Y5F1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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