Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF12Q9Y4X4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF12Q9Y4X4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms