Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SH3BP1Q9Y3L3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
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