Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAB39Q9Y376 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAB39Q9Y376 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms