Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y333

LSM2, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM2Q9Y333 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LSM2Q9Y333 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LSM2Q9Y333 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms