Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
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TPCN1Q9ULQ1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
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TPCN1Q9ULQ1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
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TPCN1Q9ULQ1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
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TPCN1Q9ULQ1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
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TPCN1Q9ULQ1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
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TPCN1Q9ULQ1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
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TPCN1Q9ULQ1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
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TPCN1Q9ULQ1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
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TPCN1Q9ULQ1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPCN1Q9ULQ1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TPCN1Q9ULQ1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TPCN1Q9ULQ1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TPCN1Q9ULQ1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TPCN1Q9ULQ1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TPCN1Q9ULQ1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TPCN1Q9ULQ1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TPCN1Q9ULQ1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TPCN1Q9ULQ1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TPCN1Q9ULQ1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TPCN1Q9ULQ1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TPCN1Q9ULQ1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TPCN1Q9ULQ1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TPCN1Q9ULQ1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TPCN1Q9ULQ1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TPCN1Q9ULQ1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
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