Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRPF3Q9ULD4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BRPF3Q9ULD4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms