Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA3Q9UL41 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms