Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AMFRQ9UKV5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AMFRQ9UKV5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms