Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TSR3Q9UJK0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSR3Q9UJK0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms