Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCN11AQ9UI33 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SCN11AQ9UI33 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms