Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IRD1Q9UHL9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms