Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA9Q9UGM1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA9Q9UGM1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA9Q9UGM1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA9Q9UGM1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA9Q9UGM1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA9Q9UGM1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA9Q9UGM1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA9Q9UGM1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA9Q9UGM1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA9Q9UGM1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA9Q9UGM1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA9Q9UGM1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA9Q9UGM1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA9Q9UGM1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA9Q9UGM1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA9Q9UGM1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA9Q9UGM1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA9Q9UGM1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA9Q9UGM1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA9Q9UGM1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA9Q9UGM1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA9Q9UGM1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA9Q9UGM1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA9Q9UGM1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA9Q9UGM1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA9Q9UGM1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA9Q9UGM1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA9Q9UGM1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA9Q9UGM1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA9Q9UGM1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA9Q9UGM1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA9Q9UGM1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA9Q9UGM1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA9Q9UGM1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA9Q9UGM1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA9Q9UGM1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA9Q9UGM1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA9Q9UGM1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA9Q9UGM1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA9Q9UGM1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA9Q9UGM1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA9Q9UGM1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA9Q9UGM1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA9Q9UGM1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA9Q9UGM1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA9Q9UGM1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms