Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNAL1Q9UBT7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTNNAL1Q9UBT7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms