Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
POLKQ9UBT6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms