Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R7

SUCLA2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLA2Q9P2R7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUCLA2Q9P2R7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SUCLA2Q9P2R7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUCLA2Q9P2R7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUCLA2Q9P2R7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUCLA2Q9P2R7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUCLA2Q9P2R7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUCLA2Q9P2R7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUCLA2Q9P2R7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUCLA2Q9P2R7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUCLA2Q9P2R7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SUCLA2Q9P2R7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUCLA2Q9P2R7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUCLA2Q9P2R7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUCLA2Q9P2R7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUCLA2Q9P2R7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUCLA2Q9P2R7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUCLA2Q9P2R7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUCLA2Q9P2R7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUCLA2Q9P2R7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUCLA2Q9P2R7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUCLA2Q9P2R7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUCLA2Q9P2R7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUCLA2Q9P2R7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUCLA2Q9P2R7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUCLA2Q9P2R7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUCLA2Q9P2R7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUCLA2Q9P2R7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUCLA2Q9P2R7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUCLA2Q9P2R7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SUCLA2Q9P2R7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUCLA2Q9P2R7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUCLA2Q9P2R7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUCLA2Q9P2R7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUCLA2Q9P2R7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUCLA2Q9P2R7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUCLA2Q9P2R7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUCLA2Q9P2R7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUCLA2Q9P2R7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUCLA2Q9P2R7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUCLA2Q9P2R7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUCLA2Q9P2R7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUCLA2Q9P2R7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUCLA2Q9P2R7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUCLA2Q9P2R7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms