Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHPF2Q9P2E5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms